İstanbul 29 Mayıs Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü 24 Nisan 2010 tarihinde kuruldu ve geleceğin akademisyenlerini yetiştirmede ciddi bir paya sahip olmak için 2012-2013 akademik yılından itibaren faaliyete geçti. Enstitümüzde, 9 anabilim dalına bağlı 9’u tezli, 7’si tezsiz toplam 16 yüksek lisans programı ile 5 doktora programına öğrenci kabul ediliyor.
İstanbul 29 Mayıs Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü Lisansüstü Programları:
| DOKTORA | ||
| Felsefe | Tezli | Felsefe Doktora Programı |
| Tarih | Tezli | Tarih Doktora Programı |
| Türk Dili ve Edebiyatı | Tezli | Türk Dili ve Edebiyatı Doktora Programı |
| Temel İslam Bilimleri | Tezli | Temel İslam Bilimleri Doktora Programı |
| Çeviribilim | Tezli | Çeviribilim (İngilizce) Doktora Programı |
